Revista de Investigación y Desarrollo Acuícola

Abstracto

Caracterización de la comunidad microbiana procariota y eucariota en estanques de camarones blancos del Pacífico

Dongwei Hou, Shenzheng Zeng, Jian Liu, Muting Yan, Shaoping Weng, Jianguo He Jianguo He y Zhijian Huang

Esta investigación describe las composiciones de la comunidad y las taxonomías dominantes de microbios procariotas y eucariotas en 30 muestras de agua de 5 estanques diferentes de camarones blancos del Pacífico. La región V4 del gen 16S rRNA y el gen 18S rRNA fueron secuenciados mediante tecnología de secuenciación de alto rendimiento. Se seleccionaron para la clasificación un total de 1.387.317 fragmentos de genes 16S rRNA y 1.612.056 18S rRNA, incluidas 3.841 Unidades Taxonómicas Operacionales (OTU) procariotas y 990 OTU eucariotas. Se observó que todas las secuencias de 16S rRNA estaban afiliadas a al menos 47 divisiones bacterianas y las secuencias de 18S rRNA estaban afiliadas a 50 divisiones eucariotas, respectivamente. Entre las 30 muestras, la comunidad procariota y eucariota dominante a nivel de filo compartió una similitud considerable en composición pero no en abundancia. La comunidad procariota dominante incluyó Actinobacteria, Proteobacteria, Cyanobacteria, Planctomycetes, Verrucomicrobia, Bacteroidetes, Chlorobi, Chloroflexi, Firmicutes y Spirochaetes. Cercozoa, Chlororhyta, Arthropoda, Stramenopiles-no identificado, Fungi-no identificado, Prymnesiophyceae, Ciliophora, Mollusca, Choanomonada y Jakobida fueron las composiciones dominantes de los eucariotas. De manera similar, existió una diferencia significativa a nivel de género entre las 30 muestras. Los resultados de riqueza y diversidad mostraron que los microbios procariotas y eucariotas poseían composiciones comunitarias complejas en 5 estanques. Mientras que en diferentes períodos y diferentes estanques, el valor del índice de Chao, Ace, Shannon y Simpson no fue significativamente diferente (P >0,05).