Revista de tecnología microbiana y bioquímica

Abstracto

Análisis comunitario de bacterias oxidantes de amoniaco mediante genética molecular en lodos activados de plantas de tratamiento de efluentes

Diputado Shah

Investigamos las comunidades de bacterias oxidantes de amoniaco (AOB) en lodos activados mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) seguida de polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción terminal (T-RFLP), clonación y secuenciación de la subunidad alfa del gen de la monooxigenasa de amoniaco (amoA). En este estudio, se combinaron las técnicas de amplificación específica de fragmentos de ADNr 16S oxidantes de amoniaco mediante PCR, separación de muestras de PCR mixtas mediante electroforesis en gel de gradiente desnaturalizante (DGGE) e identificación de bandas mediante hibridación específica con sondas de oligonucleótidos para permitir la comparación de la composición de la comunidad de múltiples muestras en el espacio y el tiempo. También se extirparon bandas de DGGE de interés para el aislamiento de ADN, la reamplificación, la determinación de la secuencia y el análisis filogenético. Comparamos muestras mensuales de la macrófita emergente Glyceria maxima para determinar los efectos estacionales que las raíces de las plantas y la disponibilidad de oxígeno podrían tener sobre las poblaciones de oxidantes de amoniaco del subgrupo β presentes. De manera similar, se compararon cinco muestras de suelo o sedimento, con diferente disponibilidad de oxígeno, de diferentes lugares. Si bien se pudo detectar de manera diferencial la presencia de dos grupos de secuencias de Nitrosospira previamente definidos en las muestras examinadas, no hubo evidencia de un grupo en particular que fuera específico de ambientes periódicamente anóxicos.