Revista de minería de datos en genómica y proteómica

Abstracto

Evolución epigenética y reemplazo de histonas: cambios evolutivos en Drosophila H2AvD

Yoshinori Matsuo

Los cambios evolutivos en los genes H2A y H2AvD de Drosophila, que codifican histonas, se analizaron utilizando las secuencias de 12 Drosophila sp. para comprender la evolución del reemplazo de histonas y la epigenética. El gen Ball, que codifica una histona treonina quinasa, se localizó cabeza a cabeza con el gen H2AvD en siete Drosophila sp. También se encontró una secuencia de ADN fuertemente conservada en la región corriente arriba del gen H2AvD; esta secuencia es muy probablemente una señal transcripcional, porque la secuencia también se conservó en otras cuatro Drosophila sp. que no tenían un gen Ball corriente arriba. El gen SPARC, que codifica un dominio de unión al calcio, se localizó cola a cola en la región corriente abajo del gen H2AvD en 11 Drosophila sp. estudiadas. Se encontró una secuencia de ADN moderadamente conservada en la región del gen H2AvD en el sitio de empalme en el primer intrón. Se encontraron diferentes usos de codones para los genes H2A y H2AvD en 11 de los 17 aminoácidos, y se encontraron usos de codones característicos de las histonas de reemplazo (H2AvD, H4r, H3.3A y H3.3B) para los aminoácidos. El uso de codones fue considerablemente diferente en varios sitios de modificación de histonas en el gen H2A. Estos resultados sugirieron que, a diferencia de los genes H3.3 y H4r, no solo el control postranscripcional, sino también el control transcripcional desempeñaron un papel en el gen H2AvD. Además de los controles postranscripcionales, como el empalme y la traducción, el desarrollo de un sistema de control para la transcripción debe haber ocurrido durante la evolución del reemplazo de histonas y los sistemas epigenéticos.