Agrotecnología

Abstracto

Evaluación de la diversidad genética en el ñame aéreo ( Dioscorea bulbifera L) utilizando marcadores de repeticiones de secuencias simples (SSR)

Aniefiok Ndubuisi Osuagwu, Edem UL

Dioscorea bulbifera es un cultivo subutilizado de la familia Dioscoreacea ampliamente distribuido en las regiones tropicales y subsaharianas de África occidental. Se examinaron veinticinco accesiones de D. bulbifera de África occidental conservadas en el banco de germoplasma del Instituto Internacional de Agricultura Tropical (IITA) para determinar la diversidad genética utilizando diez loci microsatélites en una reacción de volumen de 25 ul en reacciones de PCR en una placa de microtitulación de 96 pocillos. La mezcla de reacción consistió en 3 µl de ADN molde de 10 ng/ µl , 2 µl de DNTP 2,5 mM, 1 µl de MgCl ₂ 2,5 mM , 1 µl de cebadores directos e inversos 1 µl, 1 µl de DMSO ₄ , 0,1 µl de ADN polimerasa Taq de 5 µg / µl (Invitrogen) y 3 µl de ADN de 10 ng/ µl . El volumen total de la reacción se completó hasta 25 volúmenes utilizando 13,4 µl de agua libre de nucleasas. El programa de PCR consistió en una desnaturalización a 94 °C durante 30 segundos, seguida de 35 ciclos de 94 °C durante 30 segundos, 55 o 45 °C durante 20 segundos y 72 °C durante 30 segundos, con un paso de extensión final a 72 °C durante 7 minutos. Se detectaron un total de 74 alelos con un número promedio de alelos de 7,4 por locus. Un valor medio de contenido de información polimórfica (PIC) de 0,74 mostró la existencia de variabilidad entre las accesiones. También se observó un valor medio de diversidad genética de 0,77. El enfoque SSR demostró ser una herramienta valiosa en la determinación de la diversidad genética y las relaciones entre las accesiones de D. bulbifera . Estos resultados son significativos en el programa de conservación y mejoramiento genético de este cultivo.