Bioquímica y Bioquímica Analítica

Abstracto

Identificación de posibles dianas farmacológicas y candidatos a vacunas contra patógenos causantes de aterosclerosis

Kanipakam Hema, Vani Priyadarshini I, Dibyabhaba Pradhan, Manne Munikumar, Swargam Sandeep, Swargam Sandeep, Natarajan Pradeep, Suchitra MM y Amineni Umamaheswari

La aterosclerosis es una enfermedad arterial inflamatoria crónica, responsable de accidentes cerebrovasculares (cerebro) y cardiovasculares (corazón), con una alta morbilidad y mortalidad en todo el mundo. Estudios epidemiológicos recientes han demostrado que patógenos infecciosos como Chlamydophila pneumoniae, Porphyromonas gingivalis y Helicobacter pylori están asociados con la enfermedad. Por lo tanto, la identificación de dianas farmacológicas comunes y candidatos a vacunas contra estos tres patógenos sería vital para la terapia y el manejo de la aterosclerosis. Se seleccionó Chlamydophila pneumoniae como organismo de referencia debido a su papel predominante en la aterosclerosis. Implementando un enfoque genómico comparativo, un enfoque genómico sustractivo, análisis de vías metabólicas, análisis de flora intestinal no homóloga y análisis de búsqueda de dominios, se identificaron 35 posibles dianas farmacológicas comunes contra patógenos de la aterosclerosis. Se realizaron estudios de localización subcelular e identificaron la proteína UvrABC como candidata a vacuna. El análisis de la vía metabólica ha demostrado que, de 35 dianas farmacológicas, 14 enzimas participaban en vías clave vinculadas a la supervivencia, proliferación y patogénesis de patógenos sin ningún mecanismo alternativo para sintetizar el producto. El análisis de la microbiota intestinal se realizó para identificar las dianas farmacológicas que no afectan a la microbiota en los humanos. Se realizó una búsqueda de dominios para las 14 dianas farmacológicas identificadas utilizando las bases de datos Pfam y SMART y se llevó a cabo un análisis de red de proteínas utilizando STRING y Cytoscape v3.2.0. Las dianas farmacológicas y los candidatos a vacunas propuestos en el presente estudio servirían como base para diseñar inhibidores potentes y vacunas de subunidades a través de un enfoque in silico para combatir la aterosclerosis causada por patógenos infecciosos.