Revista de tecnología microbiana y bioquímica

Abstracto

Identificación de Trichoderma spp. mediante código de barras de ADN y detección de actividad celulolítica

Abdelmegid I Fahmi, Ragaa A Eissa, Khalil A El-Halfawi, Hanafy A Hamza y Mahmoud S Helwa

Se realizó la identificación de especies de aislamientos de Trichoderma de diferentes lugares del delta del Nilo en Egipto y se analizaron sus actividades celulolíticas. Sobre la base de las características morfológicas, el 75% de los aislamientos se identificaron a nivel de especie y se dividieron en cuatro grupos agregados. La caracterización morfológica por sí sola fue insuficiente para identificar con precisión las especies de Trichoderma porque tienen relativamente pocos caracteres morfológicos y una variación limitada que causa superposición e identificación errónea de los aislamientos. Por lo tanto, hubo una necesidad de utilizar una técnica molecular para compensar las limitaciones de la caracterización morfológica. La secuenciación de ADN de la región 5.8S-ITS se llevó a cabo utilizando cebadores específicos ITS1 e ITS4. Al comparar las secuencias de la región 5.8S-ITS con las secuencias depositadas en GenBank utilizando el programa BLAST, todos los aislamientos pueden identificarse a nivel de especie con un porcentaje de homología de al menos el 99%. Además, se utilizó la herramienta de búsqueda TrichOKEY para evaluar la confiabilidad de Genbank y los resultados coincidieron en un 92% con los resultados de BLAST. Los datos indicaron una estrecha diversidad de especies y predominaron dos especies principales, a saber: T. longibarchiatum y T. harzianum. La distribución de nucleótidos, así como el contenido de (G+C) en la región ITS de los aislados, indicó una amplia gama de variación interespecífica. Finalmente, se evaluaron los aislados para sus actividades de celulasa total utilizando un método de celulosa-azul, para la actividad de exoglucanasas utilizando el método Avicel y para la actividad de endoglucanasas utilizando métodos de carboximetilcelulosa (CMC) y celulosa hinchada con ácido. En consecuencia, se seleccionaron once aislados como los mejores aislados entre los 28 aislados utilizados para la capacidad celulolítica.