Revista de minería de datos en genómica y proteómica

Abstracto

Proteínas y vías de interacción en tejido cerebral de pacientes con enfermedad de Alzheimer mediante espectrometría de masas

Malathi Narayan, Lisa Kirouac, Dale Chaput, Stanley Stevens, Jaya Padmanabhan y Umesh K Jinwal

La enfermedad de Alzheimer (EA) es la forma más común de demencia y la sexta causa principal de muerte en los Estados Unidos. Las principales características patológicas observadas en la EA incluyen la formación de ovillos neurofibrilares intracelulares compuestos de formas fosforiladas de la proteína tau asociada a los microtúbulos y la deposición de placas extracelulares compuestas de beta amiloide. Cdc37 es una co-chaperona de Hsp90, que recluta quinasas cliente al complejo Hsp90 para plegarse y estabilizarse. Se ha demostrado previamente que Cdc37 no solo puede unirse y preservar tau, sino también estabilizar quinasas que pueden fosforilar tau. El objetivo del estudio actual fue identificar nuevas proteínas que interactúan con Cdc37 en el tejido humano con EA en comparación con el tejido normal utilizando un enfoque basado en inmunoprecipitación combinado con espectrometría de masas. Identificamos 39 proteínas únicas que interactuaron con Cdc37 solo en muestras de EA y 7 proteínas que interactuaron con Cdc37 solo en muestras normales. Se encontró que 39 proteínas se unen a Cdc37 tanto en tejido con EA como en tejido normal. De estas, 18 mostraron una mayor interacción en el tejido con EA, 10 mostraron una mayor interacción en tejido normal y 11 mostraron una interacción igual en ambas muestras. El análisis de la vía de Ingenuity de los datos indica que estas proteínas que interactúan con Cdc37 podrían señalizar a través de las vías p70S6K, PI3K/Akt, TGFß, ErbB, NF- kB, calmodulina, p38 MAPK y JNK. La identificación de estas nuevas proteínas y vías vinculadas a Cdc37 puede indicar su papel tanto como co-chaperona no quinasa como en otras vías en el cerebro con EA.