Revista de minería de datos en genómica y proteómica

Abstracto

Genes y proteínas de la glutamil aminopeptidasa de mamíferos (ENPEP): estudios comparativos de un importante contribuyente a la hipertensión arterial

Roger S. Holmes, Kimberley D. Spradling-Reeves y Laura A. Cox

La glutamil aminopeptidasa (ENPEP) es un miembro de la familia M1 de endopeptidasas que son endopeptidasas de membrana integrales de tipo II de mamíferos que contienen zinc. La ENPEP está involucrada en la vía catabólica del sistema renina-angiotensina que forma angiotensina III, que participa en la regulación de la presión arterial y la formación de vasos sanguíneos. Se examinaron secuencias y estructuras de aminoácidos de ENPEP comparativas y ubicaciones de genes de ENPEP utilizando datos de varios proyectos de genoma de mamíferos. Las secuencias de ENPEP de mamíferos compartían identidades del 71-98%. Se conservaron cinco sitios de N-glicosilación para todas las proteínas ENPEP de mamíferos examinadas, aunque se observaron de 9 a 18 sitios, en cada caso. También se estudiaron alineaciones de secuencias, residuos de aminoácidos clave y estructuras secundarias y terciarias predichas, incluidas secuencias transmembrana y citoplasmáticas y residuos de sitios activos. Los niveles más altos de expresión de ENPEP humana se observaron en el íleon terminal del intestino delgado y en la corteza renal. Los genes ENPEP de mamíferos contenían 20 exones codificantes. El promotor del gen ENPEP humano y el primer exón codificante contenían una isla CpG (CpG27) y al menos 6 sitios de unión de factores de transcripción, mientras que la región 3'-UTR contenía 7 sitios diana de miRNA, que pueden contribuir a la regulación de la expresión del gen ENPEP en los tejidos del cuerpo. Los análisis filogenéticos examinaron las relaciones de los genes y proteínas ENPEP de mamíferos, incluidas las fuentes de primates, otros euterios, marsupiales y monotremas, utilizando ENPEP de pollo como secuencia primordial para fines comparativos.