Revista de Patología Vegetal y Microbiología

Abstracto

Caracterización patogénica y genética de razas de Xanthomonas campestris Pv. campestris basada en Rep-PCR y análisis de secuencias de múltiples loci

Priyanka Singh Rathaur, Dinesh Singh, Richa Raghuwanshi y Yadava DK

Xanthomonas campestris pv. campestris (Pammel) Dowson (Xcc) es el agente causal de la enfermedad de la podredumbre negra de las crucíferas en todo el mundo. Se recolectaron setenta y cinco aislamientos de Xcc de 12 regiones agroclimáticas de la India para determinar el patrón de distribución de las razas y la diversidad de la población. Con base en la reacción patógena en siete crucíferas diferenciales estándar, se encontró que las razas 1, 4 y 6 eran prevalentes. Para evaluar la diversidad patógena, se inocularon artificialmente cuarenta y un cultivares de crucíferas que comprendían siete especies de Brassica y coeno en condiciones de campo. Los cultivares de Brassica juncea (Pusa Bold, Varuna, Pusa Vijay, Pusa Mustard 21 y Pusa Mustard 25) mostraron resistencia contra todas las cepas de Xcc, mientras que el cultivar de Brassica olerecea Pusa Ageti resultó ser resistente a las razas 1 y 4. La caracterización genética de estas 75 cepas de Xcc se llevó a cabo utilizando rep-PCR (ERIC, REP y BOXPCR) seguida de un análisis filogenético . Las cepas de Xcc se agruparon en 6 grupos con un coeficiente de similitud del 50% y, entre estos grupos, 28 cepas de Xcc pertenecientes a las razas 1, 4 y 6 se agruparon bajo el Grupo 5. Las secuencias de los genes 16S rRNA, hrpF y efP de cinco cepas que representan las razas 1, 4 y 6 se utilizaron para el análisis de secuencias de locus múltiples. Con base en el análisis de la secuencia de los genes 16S rRNA y hrpF, se encontró que las cepas indias estaban estrechamente relacionadas con la cepa Xcc ATCC 33913 (raza 3, Reino Unido), mientras que con base en las secuencias efP, se encontró que estaban estrechamente relacionadas con las cepas raza 1 Xcc B100 (Italia) y raza 9 Xcc 8004 (Reino Unido).