Revista de bioequivalencia y biodisponibilidad

Abstracto

Optimización de la molécula líder basada en el farmacofóramo y análisis de acoplamiento molecular para la detección de un potente inhibidor contra la proteína HCRTR2

María Maqbul*

El insomnio es un problema de salud pública en aumento, ya que su prevalencia aumenta día a día. Es uno de los trastornos del sueño más comunes entre los asiáticos. Una de cada diez personas que padecen insomnio tiene insomnio. Entre todos los trastornos del sueño, alrededor del 6-10% cumple los criterios de insomnio. Es muy frecuente en mujeres en comparación con los hombres. En este trabajo de investigación, nos centramos en la identificación de posibles fármacos basados ​​en objetivos para proporcionar un tratamiento eficaz a partir de plantas medicinales. En este estudio de investigación, se utilizó un enfoque de farmacóforo basado en ligandos seguido de acoplamiento molecular y cribado virtual. Se utilizó un servidor Protox para la predicción de la clase de toxicidad. Las propiedades moleculares de los componentes químicos que poseen propiedades antiinsomnes se verificaron mediante Swiss ADME, la herramienta de predicción de propiedades ADMET y la herramienta de exploración de propiedades Osiris. Se realizó un farmacóforo basado en ligando de cuatro compuestos de Osmium basilicum y luego se lo examinó frente a las bibliotecas de Zinc, Princeton y Drug Bank utilizando el explorador de ligando y luego el compuesto con mayor puntaje de ajuste al farmacóforo con CID NS_013367, NS_005529, NS_007342, NS_011378 y NS_011361. Se seleccionó NS_011285 para el acoplamiento. Se realizó el acoplamiento molecular de la proteína HCRTR2 objetivo deseada con los compuestos seleccionados uno por uno utilizando Autodockvena y luego se seleccionó la mejor pose que muestra el mejor ángulo de orientación de ubicación para un estudio adicional que exhibe una energía de enlace mínima y los resultados del acoplamiento se analizaron a través de Pymol y Discovery Studio. El compuesto con número de CID NS_011285 posee la mejor pose y más menos energía de enlace -9,4 en comparación con otros compuestos. La estructura 2D muestra la interacción de los aminoácidos MET, VAL, LEU, PHE y ARG 2D con la proteína mutada HCRTR2 y el tipo de interacciones como Alquil, Pi-Alquil, Pi-Sigma y Pi-Azufre. Finalmente, identificamos el ligando que posee las mejores propiedades de similitud con los fármacos y el potencial para inhibir la actividad de HCRTR2, que es el principal culpable del trastorno de insomnio.