Revista de minería de datos en genómica y proteómica

Abstracto

Predicción de micro ARN contra la proteína NS1 de H5N1 y H1N1: una ventana al desarrollo de terapias específicas de secuenciación

Pankaj Koparde y Shailza Singh

Motivación: Los fármacos convencionales contra la gripe pueden resultar ineficaces debido a la naturaleza altamente variable de las proteínas antigénicas de la gripe. La predicción in silico de terapias específicas de secuencia requiere menos tiempo y es más rentable. La mayoría de las plataformas de predicción de dianas de miRNA difieren en su especificidad y sensibilidad en la predicción. Aquí proponemos un enfoque bioinformático para predecir micro ARN contra la proteína no estructural 1 del virus de la gripe aviar H5N1 y contra el segmento 8 del virus de la gripe porcina H1N1.

Resultados: se identifican los hsa-miR-138, hsa-miR-525-5p y hsa-miR-124 como posibles agentes terapéuticos específicos de secuencia contra la proteína NS1 del virus H5N1. Estudios similares sobre diferentes genomas del segmento 8 del virus H1N1 dieron como resultado la predicción de microARN que pueden usarse como agentes antigripales. Los microARN predichos también desempeñan funciones en los procesos reguladores de la célula huésped, vías relacionadas con el estrés, incluida la vía MAPK, la vía mTOR, y se descubrió que están involucrados en vías relacionadas con el cáncer.