Revista de Patología Vegetal y Microbiología

Abstracto

La huella genómica mediante Rep-PCR reveló diversidad genética y estructura poblacional entre aislamientos etíopes de Pseudocercospora griseola, patógeno del frijol común ( Phaseolus vulgaris L.)

Yayis Rezene, Kassahun Tesfaye, Mukankusi Clare, Allan Male y Paul Gepts

La mancha angular de la hoja ( Pseudocercospora griseola ) es una de las enfermedades más devastadoras que afectan la producción de frijol común en la mayor parte de Etiopía. Por lo tanto, el uso de variedades de frijol común con resistencia duradera es la medida de control más eficaz y económica. El conocimiento sobre la variabilidad genética y la estructura poblacional de las poblaciones de patógenos es importante para un programa exitoso de mejoramiento de frijol común. El objetivo de este estudio fue determinar la diversidad genómica existente entre y entre los aislamientos de P. griseola que se obtuvieron de la colección de encuesta de campo de diversas áreas de cultivo de frijol común de Etiopía. El estudio utilizó el protocolo de reacción en cadena de polimerasa de elementos palindrómicos extragénicos repetitivos para identificar la diversidad de secuencias de ADN. Para estudiar la diversidad genética, analizamos datos moleculares de 79 aislamientos de esporas únicas del patógeno P. griseola . Por lo tanto, el análisis molecular de varianza (AMOVA) y el análisis de conglomerados revelaron la existencia de una alta diversidad genética dentro y entre los aislamientos de P. griseola . La PCR ERIC produjo 21 patrones diferentes de grupos, mientras que la PCR REP y la PCR BOX produjeron 11 y 5 patrones diferentes de grupos respectivamente. Esto se debe a que algunos aislamientos que compartían los mismos patrones BOX se podían distinguir por los patrones de huellas dactilares ERIC y REP. Los patrones de huellas dactilares combinados de PCR ERIC, BOX y REP discriminaron 25 patrones diferentes entre los 79 aislamientos monospóricos de P. griseola que se produjeron en una matriz de similitud genética de corte del 77%. Estos grupos discriminados revelaron la existencia de diversidad genética dentro y entre los aislamientos de P. griseola recolectados de las diversas regiones de cultivo de frijol común de Etiopía.