Revista de tecnología microbiana y bioquímica

Abstracto

Extracción de ARN de la levadura Candida parapsilosis Sensu Stricto mediante dos métodos comerciales basados ​​en la purificación por columnas de sílice

Rodríguez ML, Rosa AC y Jewtuchowicz VM

Para estudiar la expresión génica es necesario obtener ARN de buena calidad. Se han descrito diferentes métodos de extracción de ARN, pero la calidad y el rendimiento del ARN pueden variar entre las diferentes técnicas y especies de estudio biológico. Hasta la fecha, no existe un método estandarizado para la extracción y purificación de ARN de levaduras del género Candida . Los pocos artículos disponibles sobre el tema se aplican principalmente a hongos filamentosos y han producido malos resultados para las técnicas de extracción basadas en métodos de IVD manuales o caseros. Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue comparar dos sistemas comerciales de extracción y purificación de ARN utilizando columnas de sílice (Qiagen y Zymo Research) con Candida parapsilosis sensu stricto como organismo modelo. Esta levadura ha sido identificada en artículos recientes como la segunda especie de Candida aislada con mayor frecuencia en la cavidad oral. En la última década, ha sido objeto de creciente interés médico porque es una de las principales causas de candidemia tanto en adultos como en neonatos prematuros. En vista de estos antecedentes, consideramos que el estudio del transcriptoma de Candida parapsilosis sensu stricto y sus variaciones según los cambios ambientales es una prioridad. En este estudio experimental, se procesaron 19 aislados fúngicos con Qiagen y 17 aislados con Zymo Research. Los resultados sugieren que el tampón de lisis RLT de Qiagen es esencial para obtener un producto de ARN de mejor calidad.