Maldonado Bonilla LD y Calderón-Oropeza MA
Un brote de Fusarium oxysporum f. sp. cubense Raza Tropical 4 está amenazando actualmente la producción mundial de banano. Debido a la naturaleza clonal de las plantas de banano comerciales, la selección de cultivares resistentes no parece factible; por lo tanto, se deben desarrollar enfoques alternativos para la protección de cultivos. La exorribonucleasa 5´ → 3´ XRN2/RAT1 está involucrada en la descomposición del ARN 5´ → 3´. Los estudios fúngicos con XRN2 y mutantes condicionales han ilustrado el papel crucial de esta enzima, lo que sugiere que XRN2 debe considerarse como un objetivo para la búsqueda de nuevos inhibidores que podrían usarse como fungicidas para controlar el mal de Panamá. Nuestro análisis in silico de la Raza Tropical 4 XRN2 (FocTR4XRN2) reveló características características de la exorribonucleasa 5´ → 3´, como el dominio catalítico que reconoce el ARN 5´-monofosforilado y cataliza la escisión procesada de los mononucleótidos. Una cavidad delimitada que muestra el potencial de captación de sustrato parece propensa a interactuar con pequeñas moléculas que podrían inhibir su actividad. El dominio catalítico en FocTR4XRN2 alberga un motivo CCHC, que se conserva en proteínas ortólogas de hongos filamentosos pero que falta en levaduras. Los residuos involucrados en la interacción con la pirofosfohidrolasa RAI1 también se conservan. El acoplamiento molecular revela la posible interacción de FocTR4XRN2 con el inhibidor natural adenosina 3', 5' bisfosfato, y sugiere que este enfoque es confiable para detectar nuevos inhibidores enzimáticos que podrían ayudar a suprimir la progresión de los agentes causales de la enfermedad de Panamá.