Abstracto

Análisis de la secuencia de la región espaciadora intergénica (ITS) 16S-23S: aplicabilidad y utilidad para identificar géneros y especies que se asemejan a los estreptococos no hemolíticos

Xiaohui Chen Nielsen, Derya Carkaci, Rimtas Dargis, Lise Hannecke, Ulrik Stenz Justesen, Michael Kemp, Jens Jørgen Christensen y Monja Hammer

Las especies que son cocos grampositivos, catalasa-negativos y que no pertenecen a los estreptococos o enterococos se han caracterizado cada vez mejor y el número de entidades taxonómicas crece constantemente según los estudios taxonómicos moleculares. Esto complica su identificación. El análisis de la secuencia de la región espaciadora intergénica 16S-23S (ITS) ha demostrado ser una herramienta útil para la identificación de especies de los géneros Streptococcus y Enterococcus. Este estudio investigó la posibilidad de utilizar el análisis de la secuencia ITS como una herramienta común para la identificación de especies dentro de los géneros Aerococcus, Abiotrophia, Alloiococcus, Dolosicoccus, Dolosigranulum, Facklamia, Granulicatella, Gemella, Ignavigranum, Leuconostoc y Vagococcus. Se determinaron las secuencias ITS de 29 cepas tipo y 103 cepas clínicas bien caracterizadas y se realizó un análisis BLAST para la identificación de especies. Todas las cepas clínicas se identificaron de manera convincente a nivel de especie. El análisis filogenético mostró una agrupación distinta de cepas con las especies asignadas y las cepas tipo respectivas. Por lo tanto, el análisis de secuencias ITS fue útil para la identificación de especies de bacterias pertenecientes a los géneros que son cocos catalasa-negativos y gram-positivos. Potencialmente, ITS podría considerarse como la herramienta de identificación de primera línea para el grupo de cocos catalasa-negativos, gram-positivos, incluidos los estreptococos no hemolíticos, los enterococos y los taxones examinados en este estudio.

Descargo de responsabilidad: este resumen se tradujo utilizando herramientas de inteligencia artificial y aún no ha sido revisado ni verificado