Revista de minería de datos en genómica y proteómica

Abstracto

Base de datos de interacciones entre genes y ambiente relacionadas con los lípidos en sangre, las enfermedades cardiovasculares y la diabetes tipo 2

Yu-Chi Lee, Chao-Qiang Lai, Jose M Ordovas y Laurence D Parnell

Dado que las interacciones entre genes y ambiente (GxE) desempeñan un papel importante en la modificación de la relación entre las variantes genéticas y las medidas clínicas de la enfermedad, es imprescindible tener en cuenta las interacciones entre genes y ambiente (GxE). Para facilitar la incorporación de las interacciones GxE en estudios de asociación de un solo gen y de todo el genoma, hemos recopilado a partir de la literatura una base de datos de interacciones GxE relevantes para la nutrición, los lípidos en sangre, las enfermedades cardiovasculares y la diabetes tipo 2. Se han incorporado más de 550 de estas interacciones en una única base de datos, junto con más de 1430 casos en los que se encontró una falta de significación estadística. Esta base de datos servirá como un recurso importante para los investigadores en genética y nutrición con el fin de comprender qué puntos del genoma humano son sensibles a las variaciones en la dieta, la actividad física y el consumo de alcohol, entre otras opciones de estilo de vida. Además, esta base de datos GxE se ha diseñado teniendo en cuenta la futura integración en una base de datos más grande de fenotipos nutricionales.