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Abstracto
Un nuevo servidor web para la identificación rápida de microorganismos
Olivier Croce, Francois Chevenet y Richard Christen
Las secuencias de genes de ARN ribosómico de subunidad pequeña (SSU rRNA) se utilizan ampliamente para identificar organismos microbianos. Sin embargo, las bases de datos públicas ahora comprenden principalmente secuencias de genes de ARNr resultantes de PCR y clonación de ADN aislado de muestras ambientales. La mayoría de estas secuencias están mal anotadas y no tienen asignaciones taxonómicas adecuadas. Como resultado, esta inundación de secuencias hace que las identificaciones rutinarias sean a menudo muy tediosas.
Proponemos un nuevo servidor web para identificaciones rápidas y confiables de aislamientos microbianos. Permite recuperar secuencias relacionadas y sus taxonomías, para proceder a análisis filogenéticos. Esta herramienta web se basa en bases de datos específicas de especies cultivadas para Bacteria, Archaea y Protozoa. Además, se pueden descargar varios datos que ayudan al procedimiento de identificación. El servidor también incluye un software en línea para mostrar automáticamente árboles filogenéticos anotados.