Genética hereditaria: investigación actual

Abstracto

Activación de los retrotransposones del grupo Ty1-copia de Dendrobium officinale en condiciones de estrés abiótico

Cong Li, Yuan Jiang, Yanhui Gao, Jinping Si

Utilizando el cebador universal Ty1-copia retrotransposón transcriptasa inversa (RT), el dominio conservado de transcriptasa inversa de aproximadamente 260 pb, que fue inducido por estrés por frío y estrés osmótico, fue amplificado por RTPCR de Dendrobium officinale en este estudio, indicando que el retrotransposón podría ser activado por condiciones de estrés. Los amplicones fueron recuperados y clonados para secuenciación y análisis por software bioinformático relacionado. 78 Ty1-copia retrotransposón RTs activados transcripcionalmente fueron obtenidos con alta heterogeneidad. La longitud de estas secuencias varió de 245 a 265 pb, todas las secuencias fueron ricas en AT y la homología varió de 42.9% a 99.2%. Lo mismo para Ty1-copia retrotransposón RT del genoma, diferentes elementos reguladores que actúan en cis inducidos por condiciones de estrés y las señales de transcripción de inicio, correspondientes a la caja CAAT, secuencias conservadas de la caja TATA y algunos otros elementos reguladores. Los elementos reguladores que actúan en cis inducidos por condiciones de estrés de los retrotransposones Ty1-copia activados transcripcionalmente por transcriptasa inversa aumentaron significativamente en comparación con los retrotransposones tipo Ty1-copia RT del genoma. Cuando se tradujeron a aminoácidos, algunas secuencias presentaron mutación del codón de terminación o/y mutación por cambio de marco de lectura, y todas las secuencias presentaron mutación en la secuencia conservada "SLYGKQ". Se identificaron cuatro categorías a través del análisis filogenético después de los análisis de alineamiento de sus secuencias de aminoácidos, y con la RT del genoma del retrotransposón tipo Ty1-copia que tenía una homología baja, lo que indicó que los retrotransposones Ty1-copia activados transcripcionalmente por transcriptasa inversa, que se indujeron en condiciones de estrés, tenían diferencias significativas con la RT del genoma del retrotransposón tipo Ty1-copia.