Revista de Patología Vegetal y Microbiología

Abstracto

Huellas dactilares de AFLP para la identificación de grupos de infraespecies de Rhizoctonia solani y Waitea circinata

Bimal S. Amaradasa, Dilip Lakshman y Keenan Amundsen

Las enfermedades de parches causadas por Thanatephorus cucumeris (Frank) Donk y Waitea circinata, variedades Warcup y Talbot (anamorfos: especies de Rhizoctonia) plantean una amenaza grave para el mantenimiento exitoso de varias especies importantes de césped. La confianza en los síntomas de campo para identificar los agentes causales de Rhizoctonia puede ser difícil y engañosa. Las diferentes especies de Rhizoctonia y los grupos de anastomosis (AG) varían en sensibilidad a los fungicidas comúnmente aplicados y también tienen diferentes rangos de temperatura propicios para causar enfermedades. Por lo tanto, la identificación correcta del patógeno causal es importante para predecir la progresión de la enfermedad y tomar futuras decisiones de manejo de la enfermedad. Agrupar las especies de Rhizoctonia por reacciones de anastomosis es difícil y requiere mucho tiempo. La identificación de aislamientos de Rhizoctonia mediante la secuenciación de la región del espaciador transcrito interno (ITS) puede tener un costo prohibitivo. Algunos aislamientos de Rhizoctonia son difíciles de secuenciar debido al polimorfismo de la región ITS. El polimorfismo de longitud de fragmentos amplificados (AFLP, por sus siglas en inglés) es un método de identificación fiable y rentable para investigar la diversidad genética de muchos organismos. No se han realizado análisis detallados para determinar la idoneidad del AFLP para inferir el nivel infraespecie de los aislamientos de Rhizoctonia. El objetivo del presente estudio fue desarrollar la identificación AFLP para identificar el nivel infraespecie de aislamientos desconocidos de R. solani Kühn y W. circinata. Se analizaron setenta y nueve aislamientos de R. solani (n = 55) y W. circinata (n = 24) caracterizados previamente con marcadores AFLP generados por cuatro pares de cebadores. El método de agrupación de pares no ponderados con media aritmética (UPGMA, por sus siglas en inglés) agrupó correctamente los aislamientos de R. solani y W. circinata según su AG, subgrupo AG o variedad de W. circinata. El análisis de componentes principales (PCA, por sus siglas en inglés) corroboró los agrupamientos UPGMA. Hasta donde sabemos, esta es la primera vez que se prueba el análisis AFLP como método para descifrar AG, el subgrupo AG o la variedad W.circinata en una amplia gama de aislamientos de Rhizoctonia.