Revista de Patología Vegetal y Microbiología

Abstracto

Amplificación, clonación y predicción in silico del gen de elicitina de longitud completa de Phytophthora capsici, el agente causal de la enfermedad de la podredumbre del pie de la pimienta negra

Vijesh Kumar IP, Reena N, Anandaraj M, Eapen SJ, Johnson GK y Vinitha KB

Las elicitinas son una familia de pequeñas proteínas secretadas por Phytophthora, que inducen la necrosis de las hojas en las plantas infectadas. En este trabajo, informamos sobre la clonación del gen de la elicitina de P. capsici, un patógeno vegetal oomiceto que causa daños significativos a una amplia gama de plantas hospedantes. La secuencia de la elicitina se amplificó utilizando iniciadores diseñados a partir de los genes de elicitina conocidos de otros organismos Phytophthora en función de sus motivos conservados. El tamaño del producto amplificado por PCR de 256 pb de longitud y el análisis BLAST del producto secuenciado mostraron una coincidencia perfecta con las secuencias de alfa-elicitina de P. capsici. Posteriormente, se intentó caracterizar el gen completo de la elicitina a partir de la información de la secuencia del genoma de P. capsici, consultando el producto amplificado contra el genoma. La búsqueda BLAST local contra el genoma completo identificó la secuencia codificante completa. Un análisis posterior de la secuencia identificó la secuencia promotora, el sitio de inicio de la transcripción, una secuencia señal líder y un dominio de elicitina central, con 6 residuos de cisteína conservados. Además, se modeló la estructura tridimensional de la capsiceína y se estudió la afinidad de unión del esterol y la capsiceína mediante acoplamiento molecular. El modelo desarrollado predijo una fuerte afinidad de unión para Tyr 47.