Revista de minería de datos en genómica y proteómica

Abstracto

Intento de validación de biomarcadores de kinesina derivados del tiempo de vuelo de la desorción por láser de superficie mejorada en el mesotelioma maligno

Stephen M. Brindley, Brian C. Tooker, Harvey I. Pass y Lee S. Newman

La espectrometría de masas con desorción/ionización láser de superficie mejorada (SELDI-TOF) permite a los investigadores buscar biomarcadores de enfermedades en los proteomas. La validación de los resultados de SELDI-TOF mediante metodologías tradicionales ha arrojado resultados mixtos. Se utilizaron ensayos de PCR en tiempo real, ELISA y Western blot en un intento de confirmar el vínculo entre los cánceres relacionados con el asbesto y las proteínas de la familia de las kinesinas, KIF5A y KIF18A. Estas proteínas se habían identificado mediante SELDI-TOF y análisis de árbol de clasificación y regresión (CART) en suero de pacientes con cánceres relacionados con el asbesto. Cuando se utilizaron fibras de asbesto bien caracterizadas para desafiar las líneas de células mesoteliales, se observaron resultados mixtos en la expresión de ARN de KIF5A y KIF18A. El análisis Western blot que compara los niveles de proteínas en líneas celulares de mesotelioma con células mesoteliales transformadas arrojó resultados no concluyentes, al igual que los análisis Western blot de mesotelioma humano y peritoneo no canceroso que se habían obtenido de los mismos pacientes. Estos resultados sugieren que es poco probable que las proteínas de la familia de las kinesinas detectadas por SELDI-TOF CART sean de utilidad como biomarcadores para el mesotelioma maligno.