Revista de farmacogenómica y farmacoproteómica

Abstracto

Más allá de los SNP y las CNV: farmacogenómica de las repeticiones polimórficas en tándem

Evgeny Krynetskiy

Los polimorfismos de repetición corta en tándem (STR) surgieron como una clase separada de mutación genética que, junto con los polimorfismos de nucleótido único (SNP) y las variaciones del número de copias (CNV), pueden explicar la variabilidad en la respuesta a la farmacoterapia. Los STR despiertan interés en la investigación farmacogenómica debido a su prevalencia en el genoma humano y su supuesto papel funcional como reguladores de la expresión génica. Dependiendo del algoritmo de búsqueda, existen aproximadamente entre 700 000 y 1 000 000 de loci STR con motivos de 2 a 6 pb de longitud en el genoma humano de referencia. Los STR se distribuyen de forma no aleatoria entre regiones no traducidas (UTR), secuencias codificantes de proteínas e intrones, y están sobrerrepresentados en las regiones promotoras de los genes humanos. El papel funcional de los STR se ha demostrado por los efectos en la expresión génica, el empalme, la secuencia de proteínas y la asociación con efectos patógenos. Una propiedad intrínseca de los STR es la alta tasa de mutación por expansión o contracción en el número de unidades repetidas. La variación en la longitud de los STR desempeña un papel importante en la modulación de la expresión génica, y es probable que los STR sean elementos reguladores generales que atenúen la expresión de múltiples genes. El esclarecimiento de los efectos de los STR en la expresión génica puede explicar en parte la variabilidad en la respuesta a los fármacos, algo que no se puede lograr centrando el análisis exclusivamente en los SNP o las CNV. Esta revisión resume el papel de los STR polimórficos en las manifestaciones clínicas, incluida la respuesta a la farmacoterapia.