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Journal of Pharmacogenomics & Pharmacoproteomics sigue un sistema de revisión por pares doble ciego. El revisor no conoce la identidad del autor, y el autor no conoce la identidad del revisor. Hay al menos tres o más revisores para el número total de artículos en cada número. La revista está destinada a la publicación de profesionales clínicos, médicos o de la salud, estudiantes, profesionales e investigadores, así como a grupos profesionales e instituciones.
Todos los manuscritos enviados se sometieron a un control de calidad preliminar a través de la oficina editorial seguido de un proceso de revisión por pares externos. Por lo general, el control de calidad preliminar se completa dentro de los 7 días y permanece principalmente con referencia al formato de la revista, el inglés y el alcance de la revista.