Davit Bzhalava y Joakim Dillner
En la actualidad, la detección de la presencia de virus conocidos y desconocidos en bioespecímenes se realiza de manera rutinaria mediante metagenómica viral. Debido a que la velocidad de secuenciación y el costo por base están disminuyendo rápidamente con las nuevas tecnologías de secuenciación de próxima generación, como HiSeq (Illumina), 454 GS FLX (Roche), SOLiD (ABI) e Ion Torrent Proton (Life Technologies), el análisis bioinformático es hoy una parte muy importante y cada vez más exigente del análisis metagenómico viral. En esta revisión, destacamos algunos de los principales desafíos y las herramientas bioinformáticas más comúnmente adaptadas para la metagenómica viral.