Revista de Patología Vegetal y Microbiología

Abstracto

Caracterización biológica y diversidad genética de cepas indias de Ralstonia solanacearum biovares 3 y 4 que causan marchitez bacteriana del tomate

Dinesh Singh, Shweta Sinha, Garima Chaudhary y Yadav DK

Ralstonia solanacearum biovars 3 y 4 causante del marchitamiento bacteriano del tomate (Solanum lycopersicum L.) es un devastador patógeno vegetal transmitido por el suelo en todo el mundo. Se aislaron ochenta y siete aislamientos de R. solanacearum de plantas de tomate marchitas de los estados de Jammu y Cachemira, Himachal Pradesh, Uttarakhand, Jharkhand y Orissa de la India y se caracterizaron mediante métodos tradicionales y moleculares. El biovar de R. solanacearum se determinó utilizando un conjunto de fuentes de carbono y mostró que el biovar 3 de R. solanacearum se encontró más prominente (90,2 por ciento) en todos los estados de la India, mientras que el biovar 4 se encontró en los estados de Jharkhand y Himachal Pradesh. La PCR multiplex específica del filotipo asignó los 87 aislamientos de R. solanacearum que infectan al tomate bajo el filotipo I. Para estudiar la diversidad genética, se utilizaron enfoques de BOX-PCR y tipificación de secuencias de locus múltiples. Los productos de amplificación arrojaron un patrón de huellas dactilares de BOX-PCR que oscilaba entre 500 pb y 4 kb y encontraron 23 grupos de tipificación de ADN de 87 aislados de R. solanacearum con un coeficiente de similitud del 50%. Bajo la tipificación de secuencia de múltiples locus, se realizó la tipificación de tres genes de virulencia, a saber, hrp (regulación de la transcripción reguladora) y egl (precursor de la endoglucanasa) y los genes fli C de 18 cepas de R. solanacearum pertenecientes a diferentes zonas agroclimáticas. Con base en el análisis de secuencia del gen egl, la mayoría de las cepas indias de R. solanacearum estaban muy cerca entre sí, excepto ORT-8, UTT-23 y JHT2, y estaban muy cerca de la cepa GMI1000. Se encontró mucha variabilidad genética en los aislados indios de R. solanacearum independientemente del lugar de aislamiento y las condiciones climáticas.