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Abstracto
Estudios comparativos y evolutivos de los genes y proteínas de la pirofosfatasa mitocondrial y citoplasmática (PPA)
Roger S. Holmes, Kimberly D. Spradling-Reeves y Laura A. Cox
La pirofosfatasa inorgánica (PPA; PPasa) (EC: 3.6.1.1) es un miembro de la familia de enzimas difosfatasas que funciona como una hidrolasa de difosfato dentro del citoplasma (PPA1) y las mitocondrias (PPA2) de los tejidos de vertebrados. Se examinaron las secuencias y estructuras de aminoácidos de PPA1 y PPA2 y las ubicaciones de genes similares a PPA utilizando datos bioinformáticos de varios proyectos de genoma. También se estudiaron las alineaciones de secuencias y los residuos de aminoácidos conservados clave (se identificaron residuos de PPA2 humanos): el péptido señal mitocondrial (1-31); y los residuos del sitio activo responsables de la unión de Mg2+ (164Asp, 169Asp y 201Asp), la unión del sustrato (127Arg) y la función como sitio donador de protones (138Tyr). Se identificaron estructuras 2D y 3D predichas para PPA1 y PPA2 de vertebrados utilizando la estructura PPA1 de levadura informada (PDB: 1E9G). Los genes PPA1 y PPA2 de vertebrados generalmente contenían 11 o 12 exones codificantes, respectivamente, con un exón 1 extendido y un exón 3 adicional observado para los genes PPA2 de vertebrados. Se identificaron sitios de unión de factores de transcripción y CpG104 dentro del promotor del gen PPA2 humano; y MiR-590 para el 3'UTR de PPA2. Los análisis filogenéticos sugirieron que un gen PPA ancestral de invertebrados experimentó un evento de duplicación génica para formar 2 líneas separadas de evolución génica de vertebrados: PPA1 y PPA2.