Comoé Koffi Donatien Benie, Adjéhi Dadié, David Coulibaly N'Golo, Nathalie Guessennd, Solange AKA, Koffi Marcellin DJE y Mireille Dosso
P. aeruginosa puede estar implicada en la intoxicación alimentaria. Es altamente patógeno para sujetos inmunodeprimidos o debilitados, causando una alta tasa de morbilidad y mortalidad. El objetivo de este estudio fue determinar el marcador filogenético adecuado para la identificación molecular de Pseudomonas aeruginosa. La pureza y concentración de los ácidos nucleicos se determinarán por espectrofotometría. Las reacciones de sensibilidad utilizando marcadores filogenéticos (16S RNAr, recA, rpoB, STS1) y el umbral de detección de 42 cepas se evaluaron por reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Con una absorción media a 230 nm de 2,1, los extractos de ADN tienen una relación media (A260/A280) de 1,7. El umbral de detección de la cepa de referencia de Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853 fue de 0,8 μg/ml para rpoB y 7,6 μg/ml para cada uno de los marcadores 16S RNAr y recA. El umbral de detección de las cepas de control positivo CP2: 1125A y CP3: API fue de 1,2 μg/ml y 0,1 μg/ml para el uso del gen rpoB, respectivamente. Este umbral fue respectivamente de 12,3 μg/ml y 0,9 μg/ml para el gen recA. La sensibilidad del gen de mantenimiento rpoB fue del 97,4%, seguida por recA y 16S RNAr con 87,2% y 82,1%, respectivamente. La resolución filogenética de los genes rpoB fue mayor que la de los genes 16S rRNA y recA. No se observará ninguna reacción de sensibilidad con el marcador ITS1. La calidad, la pureza de los ácidos nucleicos y la elección del marcador filogenético se encuentran entre los factores más críticos para el análisis de PCR.