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Abstracto
Análisis genómico comparativo de la ADP-ribosa-1′′-monofosfatasa en 19 ecotipos de Arabidopsis thaliana
Huifang Jiang, Haichao Wei, Chunyun Jiang, Wei Sun, Wen Dong, Nini Chen, Hui Zhang, Yanxiu Zhao y Zenglan Wang
La ADP-ribosa-1′′-monofosfatasa que contiene el dominio A1pp o MACRO es una enzima procesadora importante en las células, que participa en el empalme de los procedimientos del ARNt y cataliza la conversión de ADP-ribosa-1′′-monofosfato en ADP-ribosa. Identificamos dos genes, AT1G69340 y AT2G40600, en Arabidopsis thaliana y encontramos que, aunque había muchas diferencias en aminoácidos, la estructura espacial de la región conservada era similar. También analizamos la diferencia en la secuencia del promotor, la región codificante y la región no traducida utilizando los datos del genoma completo de 19 ecotipos y comparamos la expresión de ambos genes en diferentes tejidos en Col-0 y en plántulas en 19 ecotipos basados en la base de datos AtGenExpress y los datos de RNA-seq, respectivamente. Encontramos que el mismo gen tenía diferentes patrones de expresión en algunos ecotipos y los dos genes tenían patrones de expresión similares excepto en órganos florales y semillas según los datos de Col-0. Estos resultados implican que los mecanismos reguladores de la expresión de estos genes han cambiado en estos ecotipos debido a la diversidad de factores de transcripción y sitios de unión de factores de transcripción. Sobre todo, nuestra investigación proporcionará información para la descripción de la función de los genes y los candidatos a ecotipos utilizados para estudiar la función de los genes.