Revista de minería de datos en genómica y proteómica

Abstracto

Análisis de complejidad y entropía de la ADN metiltransferasa

Xiaoli Xie, Ying Yu, George Liu, Zhifa Yuan y Jiuzhou Song

Antecedentes: La aplicación de la información de complejidad sobre secuencias de ADN y proteínas en procesos biológicos está bien establecida en este estudio. Las secuencias disponibles para el gen DNMT1 se exploraron a fondo en las complejidades de la información. El gen DNMT1 es una metiltransferasa de mantenimiento responsable de copiar los patrones de metilación del ADN a las hebras hijas durante la replicación del ADN en diferentes especies. Resultados: Encontramos que la entropía del gen DNMT1 en diferentes especies depende de la composición de bases del ADN, y su complejidad en mamíferos es menor en intrones que en regiones codificantes. También demostramos los impactos de la entropía en dominios y no dominios del gen DNMT1. Los resultados de las secuencias de ADN y proteínas indicaron que la evolución del ADN tiene una tendencia hacia la complejidad. El mayor interés es que los cambios de metilación del gen a lo largo del envejecimiento en un modelo único de pollo mostraron características de entropía impulsadas por el envejecimiento, lo que puede dar una explicación de los procesos de envejecimiento. Conclusión: En resumen, la complejidad de la información del gen DNMT1 está relacionada con su composición genómica, que a su vez se asocia al procesamiento evolutivo y del envejecimiento, aunque el mecanismo intrínseco aún no se ha estudiado.