Bioenergética: acceso abierto

Abstracto

Perspectivas computacionales sobre la inhibición competitiva de la acetil coenzima A y la succinil coenzima A en el primer paso del ciclo del ácido cítrico

Salam Pradeep Singh y Bolin Kumar Konwar

El ciclo del ácido cítrico comprende varias reacciones químicas y es necesario para que todos los organismos aeróbicos generen ATP. La presente investigación se centra en la inhibición competitiva de la citrato sintasa, el primer paso del ciclo del ácido cítrico. El sustrato natural conocido de la citrato sintasa es la acetil coenzima A. Inicialmente, el primer sustrato oxaloacetato se une a la citrato sintasa, lo que induce a la enzima a cambiar su conformación, creando así un sitio de unión para la acetil coenzima A. También hay varios informes de enzima citrato sintasa inhibida por succinil coenzima A, que se asemeja a la acetil coenzima A y actúa como un inhibidor competitivo. Por lo tanto, la presente investigación se ocupa de los estudios de simulación de acoplamiento molecular de los dos sustratos, a saber, la acetil coenzima A y la succinil coenzima A en el sitio activo de la citrato sintasa para comprender los conocimientos sobre la inhibición competitiva de estos dos sustratos. Por último, también hemos
realizado el análisis de la teoría funcional de la densidad (DFT) de la acetilcoenzima A y la succinilcoenzima A para comprender la carga atómica que podría contribuir a la inhibición competitiva. Los puntajes de acoplamiento molecular y la energía de interacción revelaron que la acetilcoenzima A muestra inhibición competitiva con la succinilcoenzima A con energía favorable. Además, los estudios DFT revelaron la causa plausible de la
inhibición competitiva a nivel atómico.