Revista de Investigación y Terapéutica Biomolecular

Abstracto

Estudios conformacionales de [ 11 Ψ 12 (CN 4 )]ScyII y [ 15 Ψ 16 (CN 4 )]ScyII – Dos análogos de la esciliorhinina II mediante espectroscopia RMN 2D y métodos teóricos

Krzysztof Brzozowski, Emilia Sikorska, Hanna Miecznikowska, Katarzyna Konecko, RafaÅ‚ Åšlusarz, Jolanta Kumirska, Witold Mozga, Jacek Olczak, Janusz Zabrocki, Sylwia Rodziewicz-MotowidÅ‚o y Zbigniew Kaczyński

Se realizó un análisis conformacional de dos análogos de la esciliorhinina II [11Ψ12(CN4])]ScyII y [15Ψ16(CN4)]ScyII en DMSO-d6. Se aplicaron técnicas de RMN 2D y dinámica molecular restringida. Nuestros estudios previos habían demostrado que la esciliorhinina II adopta tres enlaces peptídicos cis en solución DMSO-d6. Además, en sus dos análogos [Aib16]ScyII y [Sar16]ScyII, también encontramos geometrías de enlaces peptídicos cis. Teniendo en cuenta lo anterior, decidimos realizar estudios conformacionales exhaustivos de análogos de ScyII restringida. Para ello, introdujimos grupos tetrazol en cada uno de los péptidos estudiados. Estos péptidos se sintetizaron mediante el método de fase sólida utilizando la química Fmoc. En el caso de dos análogos, se registraron los siguientes espectros: TOCSY, NOESY, ROESY, DQF-COSY y un conjunto de temperaturas. Para obtener las estructuras finales, realizamos simulaciones de dinámica molecular restringida utilizando el campo de fuerza CHARMM implementado en el programa XPLOR 3.11. Nuestros cálculos dieron como resultado dos conjuntos de 10 conformaciones cada uno. Al comparar las estructuras obtenidas, descubrimos que la introducción de un anillo de tetrazol 1,5-sustituido influye en la estructura tridimensional tanto a nivel local como global.