Revista global de biología, agricultura y ciencias de la salud

Abstracto

Construcción de miRNAs y perfiles de expresión génica asociados a la miocardiopatía isquémica: análisis bioinformático

Phong Son Dinh, Jun-Hua Peng, ChauMy Thanh Tran, Thanh Loan Tran, Shang-Ling Pan

Objetivo: La miocardiopatía isquémica (MII) se ha clasificado como la causa más común de morbilidad y mortalidad en los ancianos durante las últimas décadas. Una de las razones más importantes para esto es que su mecanismo subyacente exacto aún no se conoce bien.

Método: Se descargaron cinco conjuntos de datos de la base de datos GEO. La expresión génica diferencial (DGE) se identificó mediante el paquete R RobustRankAggreg. La expresión génica diferencial de miRNA se evaluó mediante el paquete Limma. Las funciones potenciales de los genes se determinaron mediante la base de datos clusterProfiler. La red reguladora de miRNA-DGE se predijo mediante cyTargetLinker. Luego, se construyó una red de interacción proteína-proteína mediante las herramientas STRING, MCODE y BiNGO.

Resultados: Se identificaron 91 miRNA y 274 genes potenciales. De ellos, se descubrió que COL1A1, IGF1 y CCND1 estaban involucrados en muchas vías de señalización y que miR-9-5p tenía un papel crítico en la miocardiopatía hipertrófica.

Conclusión: Nuestro estudio ha desentrañado los posibles genes y miRNA clave, así como la posible patogénesis molecular subyacente de la ICM, lo que constituye un paso crucial que conduce a una nueva vía para la intervención temprana de este trastorno.

Objetivo: La miocardiopatía isquémica (MII) se ha clasificado como la causa más común de morbilidad y mortalidad en los ancianos durante las últimas décadas. Una de las razones más importantes para esto es que su mecanismo subyacente exacto aún no se conoce bien.

Método: Se descargaron cinco conjuntos de datos de la base de datos GEO. La expresión génica diferencial (DGE) se identificó mediante el paquete R RobustRankAggreg. La expresión génica diferencial de miRNA se evaluó mediante el paquete Limma. Las funciones potenciales de los genes se determinaron mediante la base de datos clusterProfiler. La red reguladora de miRNA-DGE se predijo mediante cyTargetLinker. Luego, se construyó una red de interacción proteína-proteína mediante las herramientas STRING, MCODE y BiNGO.

Resultados: Se identificaron 91 miRNA y 274 genes potenciales. De ellos, se descubrió que COL1A1, IGF1 y CCND1 estaban involucrados en muchas vías de señalización y que miR-9-5p tenía un papel crítico en la miocardiopatía hipertrófica.

Conclusión: Nuestro estudio ha desentrañado los posibles genes y miRNA clave, así como la posible patogénesis molecular subyacente de la ICM, lo que constituye un paso crucial que conduce a una nueva vía para la intervención temprana de este trastorno.