Tecnología genética

Abstracto

Detección de 5-carboxilcitosina en ADN de células de mamíferos

Yihua Gao, Jian Li, Bin Chen, Qingjin Yang, Junjie Zhang, Lijian Zhang, Qionglin Huang, Xiaoxia Ye y Chun Cai

La 5-carboxilcitosina (5caC) es un derivado importante de la modificación de la citosina en la vía de desmetilación del ADN. Sin embargo, la cuantificación precisa de 5caC es un desafío, especialmente en el tejido de mamíferos. Esta situación probablemente se debe a la cantidad traza de 5caC en mamíferos y a la sensibilidad inadecuada de las tecnologías existentes. En este artículo, informamos sobre un nuevo método LC-MS/MS para cuantificar con precisión 5caC en células de mamíferos. Se sintetizó el reactivo estándar 5caC, se hidrolizó el ADN genómico con ácido fórmico y se detectó el compuesto objetivo 5caC mediante LC-MS/MS HILIC. Los resultados mostraron que 5caC existe generalmente en órganos y tejidos cancerosos de ratones. El contenido de 5caC en el cerebro de ratones fue mayor que en los pulmones y el hígado, y obviamente disminuyó en los tejidos de cáncer colorrectal en comparación con el tejido adyacente. Este resultado sugiere que 5caC probablemente se asocia con la tumorigénesis y desempeña un papel dominante en el control epigenético de la función neuronal.