Kwasi Adusei-Fosu y Matthew Dickinson
Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis (FOE), un patógeno que causa la enfermedad del marchitamiento por fusarium en la palma aceitera, se puede detectar mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), pero es un proceso que consume mucho tiempo. Se utilizó la amplificación isotérmica mediada por bucle (LAMP) para detectar rápidamente Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis (FOE) en plántulas de palma aceitera. Se tomaron muestras de ocho aislados adicionales de Fusarium oxysporum recolectados de palmeras aceiteras sintomáticas (es decir, presuntamente FOE ya que su patogenicidad no se confirmó) y otros cinco aislados no FOE de palmeras aceiteras maduras sintomáticas y tomates respectivamente para ampliar el alcance de la investigación. Las identidades de FOE, presuntamente FOE y no FOE se establecieron mediante secuenciación. Los cebadores LAMP diseñados para detectar FOE o presuntamente FOE se basaron en secuencias parciales de los citocromos Secreted in Xylem (SIX8) y P-450. El tiempo de detección más temprano para los iniciadores de citocromo SIX8 y P-450 fue de 4:00 minutos y 6:45 minutos respectivamente, y ambos registraron un tiempo de detección tardío de 26:30 minutos. Se utilizaron curvas derivadas de anexión para evaluar el nivel de especificidad para los citocromos SIX8 y P-450, pero ninguno de los iniciadores LAMP pudo distinguir entre FOE, FOE presunta y no FOE.