Revista de trastornos sanguíneos y transfusiones

Abstracto

Detección de quimerismo mixto de bajo nivel mediante genotipificación de SNP de alto rendimiento

Aleksey Nakorchevsky, Eunice Flores, Li Xiangyang, Tao Hong y Anders Nygren

Los receptores de trasplantes alogénicos de médula ósea (BMT) o de células madre (SCT) requieren un seguimiento clínico que permita el diagnóstico temprano de efectos adversos posteriores al trasplante, como rechazo, enfermedad de injerto contra huésped (GVHD) o una recaída de malignidad. La clasificación de los receptores de trasplantes en entornos clínicos se logra mediante el seguimiento de la enfermedad mínima residual (MRD) y la medición de la cantidad de quimerismo mixto en los linfocitos de sangre periférica (PBL). Si bien el seguimiento de la MRD implica la detección de marcadores específicos de malignidad, la medición del grado de quimerismo mixto se puede lograr mediante métodos generales basados ​​en PCR. Hemos desarrollado un método de genotipado de SNP para detectar niveles bajos de quimerismo mixto en PBL y ADN genómico. La sensibilidad se logra midiendo un sesgo acumulativo en los datos de genotipado en una cohorte de 92 marcadores SNP independientes. Este método mostró una sensibilidad de 0,98 y una especificidad de 0,90 para muestras de quimerismo mixto del 10 %, 5 % y 2 %. La especificidad global del método es de 0,98 y la precisión de 0,95. Los resultados muestran una concordancia del 100% con los datos STR para un conjunto de muestras clínicas. La ventaja de este método en comparación con las metodologías ya establecidas es que no requiere marcadores específicos de la enfermedad y puede multiplexarse. El método y el software de análisis también pueden utilizarse con otras tecnologías de genotipado y secuenciación.