Revista de Patología Vegetal y Microbiología

Abstracto

Desarrollo de PCR multiplex para la detección específica de Xanthomonas campestris pv. campestris en repollo y correlación con la incidencia de la enfermedad

RK Roohie y S Umesha

La podredumbre negra, la enfermedad más grave de las crucíferas, especialmente Brassica oleracea var. capitata (repollo), causa enormes pérdidas de rendimiento. La podredumbre negra es una enfermedad transmitida por las semillas y la evaluación de las semillas para el patógeno es muy crucial. Las semillas de repollo se analizaron para detectar la infección por X. campestris pv. campestris mediante análisis bioquímico y PCR. Las muestras de semillas se sometieron a análisis PCR con tres cebadores, de los cuales uno de los pares de cebadores específicos para el gen hrpF pudo detectar el patógeno de la podredumbre negra. El estudio actual es el primero de su tipo en el que se evaluaron los cultivares de repollo disponibles localmente mediante ensayos moleculares y se verificó la correlación entre los rendimientos de laboratorio y de campo de los cultivares ampliamente cultivados en el área de estudio. El objetivo del estudio fue utilizar los procedimientos basados ​​en PCR específicos y sensibles disponibles para la detección rutinaria de X. campestris pv. campestris en semillas de repollo. La PCR multiplex se estandarizó para la detección simultánea del patógeno y de la especie Brassica, espaciador transcrito interno (ITS) en semillas infectadas y material foliar. Se obtuvieron huellas dactilares de PCR multiplex que amplificaron un fragmento de 619 pb del gen hrpF de X. campestris pv. campestris y una sección de 360 ​​pb de la región espaciadora transcrita interna de Brassica sp. El ensayo también detectó fácilmente infecciones por X. campestris pv. campestris en plantas enfermas y en colonias bacterianas aisladas en medios selectivos, y fue más sensible y específico que los métodos de cultivo en placa tradicionales. Por lo tanto, mediante el uso de PCR multiplex, fue posible determinar el nivel umbral para la detección bacteriana en semillas de repollo.