Revista de tecnología microbiana y bioquímica

Abstracto

Es probable que la colonización diferencial de partes de la planta por la microbiota del rumen se deba a diferentes químicas de los forrajes.

Sharon A Huws, Olga L Mayorga, Michael K Theodorou, Eun J Kim, Alan H Cookson, Charles J Newbold y Alison H Kingston-Smith

En este experimento investigamos la hipótesis de que la heterogeneidad de las estructuras de las plantas presenta disparidad en los nichos disponibles para la colonización por la microbiota del rumen, lo que resulta en una colonización diferencial. El tallo y las hojas frescas de raigrás perenne (PRG) se incubaron en presencia de bacterias del rumen en condiciones similares a las del rumen con incubaciones cosechadas en muchos intervalos de tiempo de hasta 24 h. La degradabilidad in vitro de la materia seca (IVDMD) del material del tallo fue menor que la de las hojas en todos los momentos de cosecha. Los dendrogramas derivados de la electroforesis en gel de gradiente desnaturalizante (DGGE), el análisis canónico de coordenadas principales (CAP) y PERMANOVA demostraron que la diversidad de bacterias adheridas al material del tallo y las hojas de PRG fue diferente en todos los momentos de cosecha, aunque los datos de QPCR mostraron cantidades similares de ADNr 16S bacteriano en el material del tallo y las hojas en todos los momentos de cosecha. Por el contrario, la diversidad bacteriana en las superficies abaxial y adaxial de las hojas fue similar, pero la cantidad de 16S rDNA difirió, con más 16S rDNA en la superficie adaxial en todos los momentos de cosecha. El análisis de imágenes de microscopía electrónica de barrido de baja temperatura (LTSEM) confirmó que la cobertura de biopelícula en la superficie adaxial fue mayor que en la superficie abaxial. Demostramos que diferentes partes de la planta pueden afectar la diversidad bacteriana adherida y/o la cantidad de 16S rDNA presente. Este resultado es consistente con los conceptos de especialización de nicho por parte de la microbiota ruminal. Esta observación es particularmente relevante para comprender las interacciones planta-microbio ruminal, lo cual es necesario para el desarrollo de nuevas estrategias para mejorar la eficiencia del uso de nutrientes por parte de los rumiantes.