Revista de minería de datos en genómica y proteómica

Abstracto

Minería genómica y análisis transcripcional de genes de bacteriocinas en Enterococcus faecium CRL1879

Suárez N, Bonacina J, Hebert EM y Saavedra L*

Entre 151 aislados bacterianos de nueve quesos artesanales, Enterococcus faecium CRL 1879 mostró actividad antibacteriana contra el patógeno transmitido por alimentos Listeria monocytogenes. El aislado produjo un compuesto sensible a la proteinasa K en el sobrenadante libre de células. El análisis del genoma demostró la presencia de grupos de genes biosintéticos de enterocina A, enterocina B, enterocina P, enterocina SE-K4-like y enterocina X. Se detectaron secuencias de nucleótidos que codifican una bacteriocina putativa de dos componentes utilizando herramientas bioinformáticas, aquí denominada enterocina CRL1879αβ. Un análisis transcripcional de todos los genes de bacteriocinas mediante análisis de PCR cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) reveló la transcripción de cada gen de enterocina en diferentes niveles. Finalmente, se realizó un análisis de la distribución de genes de bacteriocinas en 251 bioproyectos de E. faecium y se comparó con los identificados en E. faecium CRL1879. El análisis discriminativo demostró que los genes de bacteriocina están ampliamente distribuidos entre Enterococcus, independientemente del origen de la cepa.

Los resultados presentados en este trabajo representan un hallazgo único ya que es la primera demostración de una cepa de E. faecium aislada de un queso artesanal con la maquinaria genética completa para producir seis bacteriocinas de clase II y una de clase III.