Revista de investigación y terapia con células madre

Abstracto

Secuenciación masiva de todo el genoma en la biología de células madre embrionarias: perspectivas y desafíos recientes

Yaofeng Wang, Alex Chun Cheung, Jun-Tao Guo y Bo Feng

El descubrimiento de células madre embrionarias pluripotentes en mamíferos ha transformado enormemente la investigación sobre células madre y la medicina regenerativa. Para comprender el mecanismo molecular de la pluripotencia, se han adoptado tecnologías de secuenciación masiva con gran interés científico debido a sus ventajas, que incluyen alta resolución, bajo ruido y su amplia cobertura en todo el genoma. Aquí revisamos los principios de las tecnologías de secuenciación masiva de todo el genoma que se utilizan ampliamente en los estudios de las células madre embrionarias, incluidas ChIP-Seq, RNA-Seq y methylCSeq. También se discutirán las mejoras y aplicaciones recientes de estas tecnologías. Además, se presentará un resumen de varias metodologías utilizadas para integrar los datos de secuenciación masiva de todo el genoma. La integración de los datos masivos que delinean diferentes aspectos de las células madre embrionarias puede impulsar numerosas innovaciones para comprender las redes de transcripción en el mantenimiento de la pluripotencia, así como las regulaciones genéticas y las modificaciones epigenéticas en las células madre embrionarias, que son importantes para la investigación y las aplicaciones clínicas. Además, destacamos las características que merecen la atención de los biólogos debido a los desafíos actuales en el análisis de datos de secuenciación masiva en bioinformática y bioestadística.