Revista de farmacogenómica y farmacoproteómica

Abstracto

Cómo la secuenciación de moléculas individuales en tiempo real puede mejorar el pronóstico y el asesoramiento genético en la distrofia miotónica tipo 1

Estefanía Tomé

La distrofia miotónica tipo 1 (DM1) es el resultado de la expansión de una repetición CTG inestable que generalmente aumenta a lo largo de las generaciones y con el tiempo en los tejidos somáticos. La inestabilidad de la repetición CTG y las manifestaciones clínicas de la DM1 dependen de la longitud de la repetición en sí y de la pureza de la secuencia repetida. El asesoramiento genético en la DM1 es muy complejo, debido a la presentación clínica altamente variable y a las dificultades técnicas para determinar el tamaño y la pureza de la expansión CTG. Utilizamos la secuenciación en tiempo real de molécula única (SMRT) de PacBio para medir con precisión el tamaño de la repetición CTG grande e identificar interrupciones de secuencia del alelo expandido para comprender la variabilidad clínica y genética en pacientes con DM1. Secuenciamos varios pacientes con DM1 con expansiones de repeticiones CTG que iban desde 130 a > 1000 repeticiones CTG en los sistemas Sequel I y II a partir de amplicones purificados. Obtuvimos más del 77% de lecturas completas de DM1 por muestra, con > 70% de las lecturas de alelos expandidos. Los datos incluyen lecturas largas en el rango de tamaño esperado para todas las muestras, incluidos los pacientes con DM1 con más de 1000 repeticiones de CTG (Tabla 1 y Ref. 1). La secuenciación SMRT es muy prometedora para secuenciar grandes expansiones de repeticiones de tripletes, identificar interrupciones de repeticiones de CTG y estimar el mosaicismo somático en pacientes con DM1. Este método puede mejorar significativamente el pronóstico y el asesoramiento ofrecido a los pacientes.