Revista de tecnología microbiana y bioquímica

Abstracto

Identificación y caracterización de los genes gtf, norB y trx en Flavobacterium Columnare

Yinfeng Zhang y Covadonga R. Arias

Se identificaron, caracterizaron y seleccionaron tres genes de una biblioteca genómica shotgun de la cepa virulenta ALG-00-530 de Flavobacterium columnare para el análisis de expresión diferencial basado en la similitud de secuencia con genes de virulencia putativos de especies relacionadas. Estos genes fueron: glicosiltransferasa (gtf), óxido nítrico reductasa (norB) y tiorredoxina (trx). Se analizó la presencia de estos genes en una colección de 30 cepas de F. columnare, incluidas cepas de los genomovares I y II. Los patrones de distribución de gtf, norB y trx en las especies no fueron uniformes. Se observó una variación en la secuencia de nucleótidos entre los genomovares para cada gen; sin embargo, las cepas dentro del mismo genomovar compartían secuencias genéticas idénticas. Se eligieron nueve cepas de F. columnare, de ambos genomovares, para el análisis de expresión génica. El perfil de expresión de estos genes varió cuando las cepas seleccionadas se cultivaron in vitro en condiciones idénticas. Se eligió ALG-00-530, una cepa altamente virulenta, para comparar la expresión génica en condiciones de crecimiento estándar, condiciones limitadas de hierro y en presencia de explantos de piel de bagre de canal. Los niveles de expresión génica de NorB y trx variaron cuando ALG-00-530 se incubó en diferentes condiciones.