Priyanka Narad y Upadhyaya KC
Las células madre embrionarias humanas (hESC) tienen la capacidad de proliferar casi indefinidamente. El análisis de los perfiles de expresión génica de las hESC podría ofrecer una perspectiva de los genes cruciales involucrados en el mantenimiento de la pluripotencia y los genes que pueden estar involucrados en la diferenciación celular. La combinación de datos de red y de alto rendimiento permite comprender el papel de los mecanismos epigenéticos, las vías de señalización y los factores de transcripción responsables de la pluripotencia humana y la detección de posibles relaciones mecanicistas, la validación del conocimiento existente, la generación de hipótesis y sugerencias para nuevos experimentos. La decodificación del núcleo de factores y sus interacciones asociadas es un comienzo importante para comprender las complejidades asociadas con las hESC y transferir el conocimiento para la creación de células madre pluripotentes inducidas humanas (hIPS). Esta revisión tiene como objetivo aumentar la información elemental de los enfoques bioinformáticos integrativos útiles para estudiar los procesos de autorrenovación y diferenciación utilizando nuevos datos holísticos sobre la expresión génica y las marcas epigenéticas asociadas con la pluripotencia celular. Se han descrito dos enfoques básicos, a saber, la representación en redes biológicas y la tecnología de la web semántica, para la gestión de datos de alto rendimiento cada vez mayor. Un enfoque integrado para desentrañar las complejidades biológicas sería muy beneficioso en el campo de las ciencias médicas y de la salud.