Revista de minería de datos en genómica y proteómica

Abstracto

Aprovechamiento de líneas celulares linfoblastoides para modelar la respuesta a fármacos

Alison A. Motsinger-Reif1,2 y Daniel M. Rotroff1,2*

Las líneas celulares linfoblastoides (LCL) se están convirtiendo en herramientas populares para modelar la respuesta a los fármacos. Las LCL y otros ensayos in vitro ofrecen la posibilidad de probar muchos fármacos, dosis y muestras biológicas de forma relativamente rápida y económica. Además, una ventaja única de las LCL es que están disponibles a partir de una gran cohorte de individuos, lo que proporciona la capacidad de probar la variabilidad genética en una escala que no está fácilmente disponible en otros sistemas in vitro. Dado que a menudo los datos del genotipo están disponibles públicamente, los costos experimentales pueden limitarse al costo de la fenotipificación de la respuesta al fármaco. Aquí describimos varias ventajas y limitaciones de las LCL. Además, revisamos varios aspectos importantes del diseño experimental y el análisis estadístico de las LCL. Por último, presentamos un ejemplo de LCL que se utilizan con éxito para identificar polimorfismos de un solo nucleótido y genes candidatos para la variabilidad en respuesta a un fármaco quimioterapéutico utilizado para tratar la leucemia mieloide crónica.