Revista de investigación y terapia con células madre

Abstracto

Células estromales mesenquimales y morfogénesis vascular: perfiles de expresión génica y vías promotoras

Rogier TA Van Wijck

RESUMEN
Objetivo: Las células hematopoyéticas y las células estromales mesenquimales están estrechamente relacionadas con las células endoteliales en los
linajes de diferenciación celular embriológica. Para estudiar la patobiología de la inmunología vascular y el microambiente
en la morfogénesis vascular, analizamos los factores genéticos que se sabe que están involucrados en anomalías vasculares en humanos
y ratones en los datos de expresión del Proyecto Genoma Inmunológico (ImmGen).
Métodos: Extrajimos información de las
bases de datos Pictures of Standard Syndromes of Undiagnosed Malformations y NCBI Online Mendelian Inheritance in Man para construir una lista de genes relacionados con la vasculatura. Estudiamos las
firmas de expresión de estos genes en la base de datos ImmGen. Se realizaron análisis de agrupamiento jerárquico utilizando Partek®
Genomics Suite 6.6. A continuación, los grupos adquiridos se investigaron por separado dentro de Ingenuity Pathway Analysis
(IPA). Con base en estos resultados, realizamos un análisis de componentes principales (PCA) con muestras de pericitos de una
base de datos separada para investigar la relación con los pericitos.
Resultados: Nuestras consultas a la base de datos dieron como resultado una lista de 438 genes relacionados con la vasculatura, de los cuales 384 pudieron
estudiarse dentro del conjunto de datos de ImmGen. A través de la agrupación jerárquica, identificamos cinco grupos distintos de los cuales
uno era específico para la expresión en líneas celulares mesenquimales. Luego, utilizando IPA, encontramos varias vías relacionadas con
las funciones de los pericitos. Un PCA posterior con muestras de pericitos mostró una gran similitud con células estromales específicas de
origen mesenquimal, lo que indica perfiles de expresión compartidos para genes vasculares entre pericitos y estos tipos de células.
Estos resultados indican que los procesos de transición epitelial-mesenquimal y/o
transición endotelial-mesenquimal subyacen a la interacción entre células epiteliales/endoteliales y células estromales mesenquimales en
la morfogénesis vascular.
Conclusión: En este estudio de análisis de datos, realizamos una fusión de datos de varias fuentes que pueden ayudar a futuros
estudios mecanísticos y terapéuticos en el diseño del estudio y la selección del tipo de célula, así como proporcionar una estrategia potencial
para encontrar objetivos terapéuticos basados ​​en los mecanismos moleculares patológicos específicos relacionados con las anomalías vasculares.