Revista de minería de datos en genómica y proteómica

Abstracto

Enfoque de proteómica microbiana para predicciones cuantitativas sensibles del péptido de unión al MHC de Taenia ovis

Gomase VS y Chitlange NR

Taenia ovis es un parásito de la tenia que se encuentra en su etapa adulta en los intestinos de los perros, mientras que la etapa intermedia o larvaria se encuentra en los músculos de las ovejas y causa el sarampión ovino. Los fragmentos peptídicos de la proteína antigénica se pueden utilizar para seleccionar nonámeros para su uso en el diseño racional de vacunas y para aumentar la comprensión de las funciones del sistema inmunológico en las enfermedades infecciosas. El análisis muestra que los péptidos de unión al complejo mayor de histocompatibilidad (MHC) de clase II de la proteína antigénica de Taenia ovis son determinantes importantes para la protección del huésped contra la infección parasitaria. En este ensayo, utilizamos los algoritmos PSSM y SVM para el diseño de antígenos y predijimos la afinidad de unión de la proteína antigénica que tiene 254 aminoácidos, que muestra 246 nonámeros. La predicción de la capacidad de unión de los péptidos antigénicos a las moléculas del complejo mayor de histocompatibilidad (MHC) de clase I y II es importante en el desarrollo de vacunas contra el sarampión ovino.