Revista de tecnología microbiana y bioquímica

Abstracto

Optimización del método de extracción para metabolómica basada en GC-MS para hongos filamentosos

Siribhorn Madla, Daisuke Miura y Hiroyuki Wariishi

La extracción de metabolitos se considera uno de los pasos más importantes para el control de calidad en la investigación metabolómica. En el presente estudio, se investigó el protocolo de extracción óptimo para metabolitos intracelulares fúngicos. Se compararon dos protocolos de extracción con diferentes sistemas de disolventes, extracción con metanol y extracción bifásica en diferentes condiciones de pH. Se tomaron en cuenta como criterios el número de picos detectados, la variación de muestra a muestra y el rendimiento de todo el proceso. Los metabolitos extraídos se analizaron mediante cromatografía de gases-espectrometría de masas (GC-MS) y análisis de componentes principales (PCA). El protocolo de extracción que utiliza metanol como disolvente de extracción proporcionó el mayor número de picos detectados (~ 300 picos) con facilidad y velocidad, lo que sugiere que el método de extracción con metanol era adecuado para la extracción de metabolitos intracelulares de P. chrysosporium. Sin embargo, dependiendo de la naturaleza de los metabolitos de interés, el método de extracción bifásica en diferentes condiciones de pH es adecuado para un análisis específico.