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Abstracto
Agrupamiento filogenético de aislamientos fecales dominantes de Escherichia coli de machos y hembras sanos en la provincia de Al-Kut/Wasit (Irak)
Sareaa MG Al-Mayahie, Alaa AM Al-Khafajy, Nuha AS Dosh, Assel RK Al-Rekabi y Ahlam GN Al-Atabie
Los aislamientos fecales de Escherichia coli se dividen en cuatro grupos filogenéticos principales denominados A, B1, B2 y D. La mayoría de las cepas comensales pertenecen al grupo A y tienen menos factores de virulencia que las cepas de E. coli patógenas extraintestinales (ExPEC). Este estudio se diseñó principalmente para la agrupación filogenética de aislamientos fecales comensales de E. coli de machos y hembras sanos en la ciudad de Al-Kut/provincia de Wasit/Irak utilizando protocolos basados en PCR. También se detectaron genes de virulencia de ExPEC entre estos aislamientos. Entre los aislamientos incluidos en este estudio (n=205), el grupo A fue el más común entre los aislamientos de hembras y machos (68,5% frente a 63,0%, respectivamente), seguido de los grupos: B1 (15,7% frente a 22,6%, respectivamente), D (10,7% frente a 9,5%, respectivamente) y B2 (4,1% frente a 4,7%, respectivamente). La distribución por género de los grupos filogenéticos mostró diferencias insignificantes entre hembras y machos. Los aislamientos de hembras y machos no difirieron significativamente para todos los genes de virulencia de ExPEC detectados, excepto para papC que fue significativamente (P ≤ 0,05) más prevalente entre los aislamientos de machos (16,6%) que entre los aislamientos de hembras (6,6%). En los aislamientos de hembras y machos los genes de virulencia más prevalentes fueron fimH (97,5% vs. 100%, respectivamente) y iucC (52,0% vs. 55,9%, respectivamente), mientras que los menos prevalentes fueron sfa/foc (0% cada uno) y hly (0,82% vs. 0%, respectivamente). Además, los genes de virulencia se concentraron en los aislamientos agrupados en el grupo B2.
En ambos sexos, un alto porcentaje de cepas comensales fecales de E. coli de la población iraquí de la ciudad de Al-Kut se agruparon en el filogrupo A, seguido de los grupos B1 y D, mientras que el grupo B2 fue poco frecuente. Además, las cepas fecales dominantes con características de ExPEC fueron mucho menos frecuentes.