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Abstracto
La filogenia de diferentes cepas de Helicobacter pylori no pudo explicarse mediante el gen ARNr 16S debido a la alta similitud en la secuencia genética entre cepas
Wenfa Ng
La comprensión de la relación evolutiva de las diferentes cepas de una especie ayudó a identificar diferencias específicas de la cepa que pueden ser útiles para el diagnóstico y el tratamiento de enfermedades. Por lo general, dicha tipificación a nivel de cepa se ampliaría con ensayos moleculares como la secuenciación de ADN y el análisis del árbol filogenético. Este trabajo utiliza datos públicos sobre la secuencia del gen ARNr 16S de diferentes cepas de Helicobacter pylori para ayudar a trazar el árbol filogenético que describe las trayectorias evolutivas de las diferentes cepas. Los resultados de la alineación de secuencias múltiples revelan un alto nivel de conservación en la secuencia del gen ARNr 16S en todas las cepas. Esto luego se traduce en una estructura de árbol filogenético que sugiere relaciones evolutivas muy cercanas de las diferentes cepas, excepto por una cepa atípica. Incluso en el caso de la cepa atípica, su distancia evolutiva con respecto a otros hermanos tampoco fue grande. En general, los resultados obtenidos en este estudio indican que el gen ARNr 16S puede no reflejar la filogenia a nivel de cepa entre diferentes cepas de la misma especie y apuntan a que se deben realizar esfuerzos para dilucidar este efecto filogenético en otros genes de la especie. Dichos genes pueden estar involucrados en la virulencia durante la patogénesis en humanos y, por lo tanto, pueden estar sujetos a una mayor presión evolutiva y selección natural.