Revista de Patología Vegetal y Microbiología

Abstracto

Se identificaron y caracterizaron los genes de la polimerasa y de la proteína de la cubierta en el virus del enanismo amarillo del trigo. Los aminoácidos deducidos se compararon con los de los miembros del grupo en Genbank

*Hoda Waziri*

Las plantas de trigo cultivadas en Egipto muestran síntomas similares a los del virus El enanismo amarillo del trigo se ha caracterizado utilizando la técnica RT-PCR. Se seleccionaron dos regiones codificantes del aislado del virus del enanismo amarillo del trigo (WYDV-PAV) para el gen de la polimerasa (P1) ubicado en el marco de lectura abierto (ORF1) y el gen de la proteína de la cubierta ubicado en el marco de lectura abierto (ORF3).
Se diseñaron dos conjuntos de cebadores específicos de acuerdo con el aislado BYDV-PAV en Genbank. Se clonaron y secuenciaron los fragmentos de ADN de ORF1 y ORF3 de un aislado egipcio de BYDV-PAV. La secuencia contenía un ORF1 de longitud completa que codificaba el gen de la polimerasa viral. Comprende 910 nt de longitud y codifica una cadena polipeptídica predicha de 303 aminoácidos con un M(r) de 34,67. Por otra parte, los datos de secuencia para el ORF3 que codifica para la proteína de la cubierta viral revelaron que tenía 603 pb de longitud y codifica una proteína predicha de 200 aminoácidos, con un peso molecular de 21,96 KDa. Sin embargo, el árbol de homología filogenética basado en los alineamientos de secuencias múltiples del aislado egipcio Egy-Wz con aquellos aislados disponibles en NCBI GenBank reveló que el gen de la polimerasa compartía 76,5%-99% y 71,6%-93,2% de identidades de secuencia a niveles de aminoácidos y nucleótidos con los aislados 05GG2, PAV 014 y PAV014, PAV-Aus respectivamente. Por otra parte, el gen de la proteína de la cubierta mostró 85,1%-99,5% y 89,7%-99,2% de similitud de secuencia con dos aislados 06KM14 y 05GG2 a nivel de aminoácidos y nucleótidos, respectivamente.