Revista de minería de datos en genómica y proteómica

Abstracto

Predicción de la estructura 3D de la toxina insecticida paralizante (ITX-1) de Tegenaria agrestis (araña vagabunda)

AGIngale y NJChikhale

La toxina insecticida paralizante (ITX-1) (Tegenaria agrestis) involucra múltiples componentes antigénicos para dirigir y potenciar el sistema inmunológico para proteger al huésped de la infección. Las toxinas peptídicas de araña con afinidades nanomolares por sus receptores son herramientas farmacológicas prometedoras para comprender el papel fisiológico de los canales iónicos y como guías para el desarrollo de nuevos agentes terapéuticos y estrategias para enfermedades relacionadas con los canales iónicos. Se desarrolló un modelo tridimensional (3D) para la toxina insecticida paralizante de la (ITX-1) de Tegenaria agrestis (araña vagabunda). Se utilizó un método de modelado de homología para la predicción de la estructura. Para el modelado, se obtuvo una proteína plantilla mediante mGenTHERADER, a saber, la estructura de cristalografía de rayos X de alta resolución de una FERREDOXINA (1FCA) de Clostridium acidurici. Al comparar la proteína plantilla, se construyó un modelo aproximado para la proteína objetivo utilizando MODELLER, un programa para modelado comparativo. El modelo se validó utilizando herramientas de verificación de la estructura de proteínas como PROCHECK y WHAT IF para comprobar su confiabilidad. La información analizada proporciona información para la comprensión molecular de la toxina insecticida paralizante (Tegenaria agrestis). El modelo 3D previsto puede utilizarse posteriormente para caracterizar la proteína en el laboratorio.